文章摘要

全面分子筛选：从RT-PCR 到RNA 测序

作者: 1Carlota Costa, 1Ana Giménez-Capitán, 1Niki Karachaliou, 1,2Rafael Rosell
1 Breakthrough Cancer Research Unit, Pangaea Biotech S.L, USP Dexeus University Institute, Barcelona, Spain
2 Catalan Institute of Oncology, Hospital Germans Trias i Pujol, Ctra. de Can Ruti s/n. 08916 Badalona, Spain
通讯: Carlota Costa Email: ccosta@pangaeabiotech.com
DOI: 10.3978/j.issn.2095-6959.2015.04.035

摘要

到目前为止，对肿瘤和非肿瘤中mRNA表达的分析主要是通过RT-PCR方法。认为它是测定特定靶 基因的拷贝数的金标准。RT-PCR的应用提示RNA转录水平可以辅助对各种疾病患者进行分类和预 测其预后，这为一些重要的临床试验提供了依据。然而，定量PCR数据质量的固有变异性使其很 难重复，并且分析某个基因需要在实验室耗费大量时间。此外，比较基因在不同的实验中的表达 水平往往很困难，并且需要复杂的标准化方法。多年来，许多已开发的技术均未能很好地应用于 临床。RNA测序是一个新的、简单而有效的用来测定转录组的构成及发现新的外显子或基因的方 法。该技术的优点是可重复性高，测序范围广，对RNA样本量的要求低，即使没有基因组测序也 能够检测新的转录和剪接。然而，这种RNA测序技术不可能取代目前的RT-PCR方法，但能够根据 需求及医院和实验室的资源与其互补。先以RNA测序确定出部分基因，再利用RT-PCR方法进行进 一步的检测。这两个互补的技术能够识别肿瘤所有的分子特征，若作为常规分析应用于癌症实验 室，将有助于对病人的分类，同时可以协助肿瘤学家做出临床决策。
关键词： 分子筛选 RT-PCR RNA测序 mRNA表达

Comprehensive molecular screening: from the RT-PCR to the RNA-seq

Authors: 1Costa Carlota, 1Giménez-Capitán Ana, 1Karachaliou Niki, 1,2Rosell Rafael
1 Breakthrough Cancer Research Unit, Pangaea Biotech S.L, USP Dexeus University Institute, Barcelona, Spain
2 Catalan Institute of Oncology, Hospital Germans Trias i Pujol, Ctra. de Can Ruti s/n. 08916 Badalona, Spain

CorrespondingAuthor: Costa Carlota Email: ccosta@pangaeabiotech.com

DOI: 10.3978/j.issn.2095-6959.2015.04.035

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