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非酒精性脂肪性肝炎关键基因的鉴定及通路分析

  
@article{LCBL43851,
	author = {懿 陈 和 丹 严 和 雪 李 和 友才 张},
	title = {非酒精性脂肪性肝炎关键基因的鉴定及通路分析},
	journal = {临床与病理杂志},
	volume = {41},
	number = {12},
	year = {2021},
	keywords = {},
	abstract = {目的:非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)是最常见的慢性肝病之一,包括非酒精性单纯性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver,NAFL)、非酒精性脂肪性肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)、肝硬化,最终可能发展为肝细胞癌。本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)构建一个基因共表达网络,以探索NASH发生发展的潜在关键通路和基因。方法:数据来自基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中GSE48452和GSE89632两个数据集。使用WGCNA确定与NASH相关的模块。通过功能富集分析,探讨其潜在的生物学功能,并对这些基因进行蛋白质-蛋白质相互作用分析。结果:GSE48452数据集中的黑色模块、GSE89632数据集中的灰色模块与NASH相关最显著。基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析显示目标基因的生物学功能分别集中在脂质降解、核染色体及有机酸的结合。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路显示基因在过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator-activated receptor,PPAR)通路富集尤为显著。结论:通过WGCNA分析,确定了与NASH相关的潜在基因[脂蛋白脂肪酶(lipoprotein lipase,LPL)、胸苷酸合成酶(thymidylate synthetase,TYMS)、细胞色素P450家族26亚家族A成员1(cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1,CYP26A1)、脂肪酸结合蛋白4(fatty acid-binding protein 4,FABP4)、脂肪酸结合蛋白5(fatty acid-binding protein 5,FABP5)、微染色体维持蛋白2(minichromosome maintenance protein 2,MCM2)、微染色体维持蛋白5(minichromosome maintenance protein 5,MCM5)、GINS复合物亚单位2(GINS complex subunit 2,GINS2)]及关键通路。这些基因可能参与NAFL到NASH的转化过程,具有一定的诊断和治疗价值。},
	url = {https://lcbl.amegroups.com/article/view/43851}
}