LCBL 阅读工具

@article{LCBL41158,
	author = {蔚 蒋 和 蛟龙 万 和 元飞 包 和 新 王},
	title = {急性缺血性卒中相关基因的筛选和验证},
	journal = {临床与病理杂志},
	volume = {40},
	number = {9},
	year = {2020},
	keywords = {},
	abstract = {目的：通过分析基因表达谱，探讨缺血性脑卒中(ischemic stroke，IS)的分子机制和诊断标志物。方法：下载GEO数据库中缺血性卒中患者和对照组的基因芯片数据，使用Pubmed提供的GEO2R软件和R语言筛选出具有显著意义的差异基因(differential genes，DEGs)；利用Metascape进行基因本体(gene ontology，GO)与酶和通路数据库(Reactome)基因集分析；使用STRING在线分析工具和Cytoscape软件分析出关键基因；最后，收集急性卒中患者外周血，通过RT-PCR进行验证。结果：通过分析IS患者外周血基因芯片数据集，共筛选出20个差异表达基因；基因注释和信号途径分析表明，这些差异表达基因主要参与中性粒细胞脱颗粒、对外来生物刺激反应、细胞因子生产、有机阴离子运输、对脂肪酸的反应和中性粒细胞迁移等。使用Cytoscape和MCODE插件进一步分析，筛选出5个关键基因(MMP-9，OLFM4，ORM1，FOLR3和ARG1)；RT-PCR证实ARG1和MMP9 mRNA在IS患者外周血中过表达。结论：缺血性卒中伴随多个基因表达异常，本研究为探索IS的发病机制和开发新的诊治疗策略提供了线索。},
	url = {https://lcbl.amegroups.com/article/view/41158}
}